MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae TCDC-NG08107 chromosome

Total Repeats: 40406

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017511	CTG	3	9	523	531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334896
2	NC_017511	TGCT	2	8	574	581	0 %	50 %	25 %	25 %	385334896
3	NC_017511	GAA	2	6	661	666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334896
4	NC_017511	TGC	2	6	673	678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334896
5	NC_017511	CGG	2	6	681	686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334896
6	NC_017511	GC	3	6	735	740	0 %	0 %	50 %	50 %	385334896
7	NC_017511	ATA	2	6	827	832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334896
8	NC_017511	TAA	2	6	834	839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334896
9	NC_017511	TGA	2	6	894	899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334897
10	NC_017511	CGC	2	6	930	935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334897
11	NC_017511	CGA	2	6	936	941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334897
12	NC_017511	CCG	2	6	1001	1006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334897
13	NC_017511	AAT	2	6	1244	1249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334897
14	NC_017511	GCG	2	6	1285	1290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334897
15	NC_017511	T	7	7	1301	1307	0 %	100 %	0 %	0 %	385334897
16	NC_017511	CGG	2	6	1377	1382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334897
17	NC_017511	GTT	2	6	1450	1455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334897
18	NC_017511	GCA	2	6	1485	1490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334897
19	NC_017511	GCG	2	6	1505	1510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334897
20	NC_017511	CGG	2	6	1530	1535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334897
21	NC_017511	GGA	2	6	1539	1544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334897
22	NC_017511	GTT	3	9	1567	1575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334897
23	NC_017511	GCCG	2	8	1581	1588	0 %	0 %	50 %	50 %	385334897
24	NC_017511	ATG	2	6	1827	1832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334898
25	NC_017511	TGG	2	6	1903	1908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334898
26	NC_017511	CGG	3	9	1945	1953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334898
27	NC_017511	AGG	2	6	1960	1965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334898
28	NC_017511	TGGG	2	8	1980	1987	0 %	25 %	75 %	0 %	385334898
29	NC_017511	GGT	2	6	2111	2116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334898
30	NC_017511	TGA	2	6	2252	2257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334898
31	NC_017511	GGC	2	6	2324	2329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334898
32	NC_017511	CAG	2	6	2472	2477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334899
33	NC_017511	GGA	2	6	2522	2527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334899
34	NC_017511	CG	3	6	2533	2538	0 %	0 %	50 %	50 %	385334899
35	NC_017511	CTGG	2	8	2727	2734	0 %	25 %	50 %	25 %	385334899
36	NC_017511	GAC	2	6	2748	2753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334899
37	NC_017511	GC	3	6	2774	2779	0 %	0 %	50 %	50 %	385334899
38	NC_017511	CGG	2	6	2882	2887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334899
39	NC_017511	CGG	2	6	2933	2938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334899
40	NC_017511	GC	4	8	2975	2982	0 %	0 %	50 %	50 %	385334899
41	NC_017511	TGG	2	6	3037	3042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334899
42	NC_017511	GAC	2	6	3051	3056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334899
43	NC_017511	T	7	7	3153	3159	0 %	100 %	0 %	0 %	385334900
44	NC_017511	G	6	6	3161	3166	0 %	0 %	100 %	0 %	385334900
45	NC_017511	CGG	2	6	3195	3200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334900
46	NC_017511	TGGA	2	8	3212	3219	25 %	25 %	50 %	0 %	385334900
47	NC_017511	TGTTT	2	10	3231	3240	0 %	80 %	20 %	0 %	385334900
48	NC_017511	GAA	2	6	3260	3265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334900
49	NC_017511	GCG	2	6	3266	3271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334900
50	NC_017511	GGC	2	6	3443	3448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334900
51	NC_017511	GGTTGA	2	12	3463	3474	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385334900
52	NC_017511	CGC	2	6	3780	3785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
53	NC_017511	TTG	2	6	3841	3846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
54	NC_017511	ATG	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334901
55	NC_017511	GGC	2	6	3932	3937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
56	NC_017511	TGT	2	6	3938	3943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
57	NC_017511	CGG	2	6	3944	3949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
58	NC_017511	GGC	2	6	3960	3965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
59	NC_017511	GGC	2	6	4118	4123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
60	NC_017511	GCCT	2	8	4158	4165	0 %	25 %	25 %	50 %	385334901
61	NC_017511	GCC	2	6	4191	4196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
62	NC_017511	TTGG	2	8	4227	4234	0 %	50 %	50 %	0 %	385334901
63	NC_017511	TAG	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334901
64	NC_017511	CTG	2	6	4271	4276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334901
65	NC_017511	GTT	2	6	4287	4292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
66	NC_017511	CGG	3	9	4310	4318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
67	NC_017511	TTG	2	6	4369	4374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
68	NC_017511	GCT	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334901
69	NC_017511	TG	3	6	4531	4536	0 %	50 %	50 %	0 %	385334901
70	NC_017511	TGT	2	6	4541	4546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
71	NC_017511	CTGC	2	8	4549	4556	0 %	25 %	25 %	50 %	385334901
72	NC_017511	GCC	2	6	4575	4580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
73	NC_017511	CGG	2	6	4601	4606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
74	NC_017511	GCC	2	6	4629	4634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
75	NC_017511	GCC	2	6	4640	4645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
76	NC_017511	GAT	2	6	4678	4683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334901
77	NC_017511	ATG	2	6	4741	4746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334901
78	NC_017511	TTG	2	6	4762	4767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
79	NC_017511	GGC	2	6	4902	4907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
80	NC_017511	GCG	2	6	5135	5140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
81	NC_017511	TTTC	2	8	5150	5157	0 %	75 %	0 %	25 %	385334901
82	NC_017511	CTG	2	6	5160	5165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334901
83	NC_017511	GCC	2	6	5255	5260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
84	NC_017511	CGC	2	6	5267	5272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
85	NC_017511	GGC	2	6	5291	5296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
86	NC_017511	CGGGT	2	10	5398	5407	0 %	20 %	60 %	20 %	385334901
87	NC_017511	CGC	2	6	5468	5473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
88	NC_017511	GGC	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
89	NC_017511	CG	4	8	5579	5586	0 %	0 %	50 %	50 %	385334901
90	NC_017511	CG	3	6	5604	5609	0 %	0 %	50 %	50 %	385334901
91	NC_017511	GGC	2	6	5627	5632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
92	NC_017511	TTG	2	6	5691	5696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
93	NC_017511	TGA	2	6	5702	5707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334901
94	NC_017511	GTGC	2	8	5760	5767	0 %	25 %	50 %	25 %	385334901
95	NC_017511	CGT	2	6	5783	5788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334901
96	NC_017511	CGG	2	6	5807	5812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
97	NC_017511	GTC	2	6	5856	5861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334901
98	NC_017511	GAAACA	2	12	5863	5874	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385334901
99	NC_017511	GGC	2	6	5901	5906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
100	NC_017511	GGC	2	6	6202	6207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334902
101	NC_017511	ATCA	2	8	6226	6233	50 %	25 %	0 %	25 %	385334902
102	NC_017511	CAC	2	6	6235	6240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385334902
103	NC_017511	AGC	2	6	6243	6248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334902
104	NC_017511	GCC	2	6	6322	6327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334902
105	NC_017511	CGTG	2	8	6387	6394	0 %	25 %	50 %	25 %	385334902
106	NC_017511	TGA	2	6	6450	6455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334902
107	NC_017511	GGC	2	6	6481	6486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334902
108	NC_017511	ACT	2	6	6554	6559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334903
109	NC_017511	CGC	2	6	6588	6593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334903
110	NC_017511	CCG	2	6	6605	6610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334903
111	NC_017511	CG	3	6	6625	6630	0 %	0 %	50 %	50 %	385334903
112	NC_017511	CCGC	2	8	6631	6638	0 %	0 %	25 %	75 %	385334903
113	NC_017511	GGCA	2	8	6654	6661	25 %	0 %	50 %	25 %	385334903
114	NC_017511	GAT	2	6	6666	6671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334903
115	NC_017511	TTGC	2	8	6672	6679	0 %	50 %	25 %	25 %	385334903
116	NC_017511	GGC	2	6	6753	6758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334903
117	NC_017511	GAT	2	6	6768	6773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334903
118	NC_017511	GGC	2	6	6859	6864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334903
119	NC_017511	TTG	2	6	6925	6930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334903
120	NC_017511	CCTTTG	2	12	6958	6969	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385334903
121	NC_017511	CG	3	6	7025	7030	0 %	0 %	50 %	50 %	385334903
122	NC_017511	CGC	2	6	7073	7078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334903
123	NC_017511	TGG	2	6	7115	7120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334903
124	NC_017511	CCG	2	6	7162	7167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334903
125	NC_017511	GCC	2	6	7237	7242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334903
126	NC_017511	GGT	2	6	7284	7289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334903
127	NC_017511	CGC	2	6	7329	7334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334903
128	NC_017511	TTC	2	6	7363	7368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385334903
129	NC_017511	CG	3	6	7387	7392	0 %	0 %	50 %	50 %	385334903
130	NC_017511	GCG	2	6	7438	7443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334903
131	NC_017511	T	6	6	7451	7456	0 %	100 %	0 %	0 %	385334903
132	NC_017511	CGG	2	6	7457	7462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334903
133	NC_017511	GGC	2	6	7479	7484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334903
134	NC_017511	TAT	2	6	7562	7567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334903
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259	NC_017511	CGG	2	6	13002	13007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334908
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392	NC_017511	CGG	2	6	18978	18983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334915
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460	NC_017511	GGT	2	6	21762	21767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334916
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474	NC_017511	T	6	6	22168	22173	0 %	100 %	0 %	0 %	385334916
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496	NC_017511	ACG	2	6	23655	23660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334918
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499	NC_017511	CGG	3	9	23749	23757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334918
500	NC_017511	CGG	2	6	23776	23781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334918

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